Polovina z 31 navrhovaných území, na které se má vztahovat ochrana kvůli výstavbě vodních nádrží, leží v Povodní Moravy, které je nejvíce zasaženo suchem. Sedm dalších ministerstvo zemědělství navrhlo v rámci Povodí Vltavy. Podle ministra Miroslava Tomana je však výstavba vodních nádrží možná nejdříve za sedm let.